Генетическая характеристика крупного рогатого скота герефордской породы Тюменской области с использованием микросателлитных ДНК-маркеров

Abstract

В статье представлены результаты исследования полиморфизма 15 микросателлитных локусов крупного рогатого скота герефордской породы. Материалом для исследования послужили ткани уха 35 животных из ООО «Бизон» Тюменской области. Материалом для исследования являлись пробы ткани уха животных. Выделение ДНК и идентификацию фрагментов амплификации проводили в Молекулярно-генетической лаборатории Государственного аграрного университета Северного Зауралья (г. Тюмень). Набор маркеров для анализа включал 15 микросателлитов – BM 1818, BM 1824, BM 2113, CSRM 60, CSSM 66, ETH 3, ETH 10, ETH 225, ILST 006, INRA 023, SPS 115, TGLA 53, TGLA 122, TGLA 126, TGLA 227.В результате обследования установлено, что 15 микросателлитных локусов включали в себя 104 аллеля, частоты которых колебались в диапазоне от 0.014 до 0.700. Среднее число информативных аллелей на локус составляло 6.93, эффективных аллелей – 4.96 или 71.6%. Увеличение числа аллелей в локусе сопровождалось повышением уровня полиморфности. Наибольшим уровнем полиморфности характеризовался локус TGLA 53 с числом эффективных аллелей равным 10.0, а наименьшим локус TGLA 126 с числом эффективных аллелей – 2.3. Избыток гетерозигот наблюдали по оставшимся девяти локусам, где индекс фиксации колебался в диапазоне от минус 0.544 по локусу CSRM 60 до минус 0.038 по локусу TGLA 227. Средний уровень наблюдаемой гетерозиготности составлял 0.770, ожидаемой – 0.692, индекс фиксации Райта имел величину равную минус 0.113, что указывало на высокий уровень генетического разнообразия стада герефордского скота.

The article presents the results of the study of polymorphism of 15 microsatellite loci of Hereford cattle. The material for the study was the ear tissue of 35 animals from LLC «Bison» of the Tyumen region. Material for research was the tissue sample of the ear of animals. DNA extraction and identification of amplification fragments were carried out in the Molecular genetic laboratory of the state agrarian University of the Northern TRANS-Urals (Tyumen). The set of markers for analysis included 15 microsatellites – BM 1818, BM 1824, BM 2113, CSRM 60, CSSM 66, ETH 3, ETH 10, ETH 225, ILST 006, INRA 023, SPS 115, TGLA 53, TGLA 122, TGLA 126, TGLA 227.The survey found that 15 microsatellite loci included 104 alleles, the frequencies of which ranged from 0.014 to 0.700. The average number of informative alleles per locus was 6.93, effective alleles – 4.96 or 71.6%. The increase in the number of alleles in the locus was accompanied by an increase in polymorphism. The highest level of polymorphism was characterized by TGLA 53 locus with the number of effective alleles equal to 10.0, and THE lowest tgla 126 locus with the number of effective alleles – 2.3. Excess heterozygotes were observed at the remaining nine loci, where the fixation index ranged from minus 0.544 at the CSRM 60 locus to minus 0.038 at the TGLA 227 locus. The average level of observed heterozygosity was 0.770, expected – 0.692, Wright fixation index was equal to minus 0.113, indicating a high level of genetic diversity of herds of Hereford cattle.